home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00184 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  48 lines
  1. **************************************************
  2. * Arthropod hemocyanins / insect LSPs signatures *
  3. **************************************************
  4.  
  5. Hemocyanins are copper-containing  oxygen  carriers occurring freely dissolved
  6. in the hemolymph of many molluscs  and  arthropods [1]. Arthropods hemocyanins
  7. consist  of  hexamer or  multi-hexamers with  subunits of about 75 Kd. Each of
  8. these subunits binds two copper ions.
  9.  
  10. Larval storage proteins (LSP) [2] are proteins  from the hemolymph of insects,
  11. which may serve as  a  store of  amino acids  for synthesis of adult proteins.
  12. There are two classes of LSP's: arylphorins,  which are rich in aromatic amino
  13. acids, and methionine-rich LSP's.  LSP's forms hexameric complexes.  LSP's are
  14. structurally related to arthropods hemocyanins.
  15.  
  16. In the lepidopteran Trichoplusia ni  a  protein  has  been  found [3] which is
  17. associated with larval metamorphosis.  This  protein,  which  is called acidic
  18. juvenile hormone-suppressible protein 1 (AJSP-1) is  also structurally related
  19. to arthropods hemocyanins.
  20.  
  21. As signature patterns for these  proteins  we selected  two conserved regions,
  22. the first  of  these  regions is located  in the  N-terminal  section of these
  23. proteins  and  include a conserved  histidine  residue  which, in hemocyanins,
  24. binds a copper atom.  The second pattern is located in the central part of the
  25. protein.
  26.  
  27. -Consensus pattern: Y-[FYW]-x-E-D-[LIVM]-x(2)-N-x(6)-H-x(3)-P
  28.                     [H is a copper ligand in hemocyanins]
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  30.  for AJSP-1 and Calliphora vicina arylphorins.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32.  
  33. -Consensus pattern: T-x(2)-R-D-P-x-F-[FYW]
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  35. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  36.  
  37. -Note: see also the pattern for the copper B binding site  of tyrosinase; this
  38.  pattern will also pick up all arthropods and molluscs hemocyanins.
  39.  
  40. -Last update: December 1992 / Text revised.
  41.  
  42. [ 1] Linzen B.
  43.      Naturwissenschaften 76:206-211(1989).
  44. [ 2] Willott E., Wang X.-Y., Wells M.A.
  45.      J. Biol. Chem. 264:19052-19059(1989).
  46. [ 3] Jones G., Brown N., Manczak M., Hiremath S., Kafatos F.C.
  47.      J. Biol. Chem. 265:8596-8602(1990).
  48.